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https://adamtongji.github.io/2018/04/19/a/

JP: 当你有超过18个月前的回忆，并且想起时仍有情绪反应。这意味着你并没有把这段记忆整理清楚，没有能够理解其中的因果，也没有能从这段记忆中解脱出来，使之成为内心的重负，大脑也会产生更多的压力激素皮质醇，而皮质醇是让人加速衰退的罪魁祸首。

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类似于时间管理，这是一本讲认知讲人性的书籍。通过对人天性和习惯的挖掘，来理解如何提升学习和工作效率。 读这本书的目的，1. 是再过一遍作者的观点；2. 更重要的是要在生活和学习中理解实践这些观点。 3.通过写博客，加深对观点的理解。打字本身会比光过脑子有效得多。

https://adamtongji.github.io/2018/01/02/%E6%9C%BA%E5%99%A8%E5%AD%A6%E4%B9%A0%E9%97%AE%E7%AD%94/

机器学习模型有哪些？有监督线性分类器，包括KNN，线性分类(LDA)，广义线性分类（Logistic)等。 有监督线性回归，包括线性回归，LASSO/ridge回归等。 有监督非线性分类器，包括SVM，随机森林（决策树）和神经网络等等。无监督分类器，包括PCA，Kmeans等等。

https://adamtongji.github.io/2018/05/27/GATK/

五月初正式开始上班，工作的第一个任务，就算搭建一个外显子和转录组突变的分析平台。而开始就是，什么都没有。没有电脑，没有服务器，也没有任何软件和经验。我们的工作就是一步步搭建起突变分析及定制化分析平台。下面我从硬件和软件两个角度，整理下平台搭建的细节和思路。出于费用限制，我这里采用的是GATK4的开源流程，并于本地计算。若下面有相关费用支持，则继续测试Google Cloud平台和Sentieon的流程，云加商业化Pipeline也是现在商业化快服务需求的标准配置吧。服务器/工作站/主机采购外显子及转录组的突变分析流程，需要较大的计算通量和高并行计算支持。我手头只有一台12年的mbp，显然无法完成流程搭建。只能另辟蹊径，由于公司的新员工可以配新的办公电脑，在同事们将近两周的支持下，我配了一台20核40线程，64GB内存加4T机械，256G固态的“办公电脑”，作为我们分析硬件平台。

https://adamtongji.github.io/2018/10/14/Wordpress_Docker/

零代码基础——Docker应用之一键化安装Wordpress

https://adamtongji.github.io/2017/12/01/%E6%9A%97%E6%97%B6%E9%97%B42/

人的大脑分为远古天性大脑和后天理性大脑。远古大脑保证了其一致的道德底线，但是相对理性大脑，有着诸多劣势。 人的天性对短时间的回报和损失高度敏感，而无法对长期受益损失有所回应。在投资上，会导致对短期收益和损失的过度重视，造成投资中非理性操作，比如高买，低卖。在生活中，会为了一点点面子和人大闹一场，甚至大打出手，而实际这个影响持续不了一天，对未来也无任何坏处。 并且，人的天性，在历史进程中和发育过程中占据主导地位。尤其是后天理性大脑消耗过度，人的大脑很容易为天性大脑主宰，做出过激非理性行为。 幸运的是，改变是大脑的天性，理性大脑本身是可以被培养强化的。用一般认知强化的方法，就可以对理性大脑的能力进行强化。 有时候，天性也是可以被利用的。比如减肥计划，deadline基金等。了解自己的天性和理性对提升自己的效率和生活质量都有很大的帮助。

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零代码基础——Docker应用之一键化安装Wordpress

https://adamtongji.github.io/2017/11/28/python-sklean/

主要分类 clustering classification regression dimension reduction

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特训班科目整理 数理化 理论物理一月特训班 本科物理一月特训班 本科数学一月特训班 编程语言 Javascript零基础进阶班 Python零基础10天进阶班 Java零基础特训班 HTML5+CSS3零基础特训班 Andriod开发零基础特训班 微信小程序零基础特训班 Ajax+JQuery零基础特训班 软件开发及算法进阶 实用数据挖掘和人工智能一月特训班 人工智能、大数据和复杂系统一月特训班 程序员成长攻略零基础特训班 计算机一月特训班（正在进行） 数据结构与算法进阶班 语言升级 零基础实用留学德语一月特训班 法语零基础一月特训班 零基础突破日语N5一月特训班 BEC商务英语一月特训班 金融财管会 CFA Level 1一月特训班 经济金融一月特训班 零基础也能学量化——量化投资一月特训班 文法及其他 西方哲学一月特训班 公务员联考一月特训班 机械设计制造及自动化一月特训班 国家法律职业资格考试特训班

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layout: posttitle: 老沙生信软件评测第一期： esATACcategories: [Bioinformatics, software, 评测系列]description: 生信软件专业测评keywords: bioinformatics, software, esATAC—

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个人简介： 读研时候使用了上百种生信软件/数据库，主要工作就是评估生信软件，靠比比软件就发了paper毕业了。

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引用自模板：没有链接的博客是孤独的

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ENCODE数据库深入挖掘——发现增强子预测新方法今天分享的是标题为Differential analysis of chromatin accessibility and histone modifications for predicting mouse developmental enhancers的文献。这篇文章发表于2018年8月22日发表于Nucleic Acid Research（IF=11.5），该工作通过ENCODE公共数据探索并发现了组织中预测增强子的新方法。