This code accompanies the paper: Sebastian Sakowski, Marta Majchrzak, Jacek Waldmajer, Pawel Parniewski: TRS-omix: a new search engine for trinucleotide flanked sequences. 2021.
The content of the repository comes from it's predecessor, i.e.: https://github.com/TRS-omix/software
"Proste tematy" 0. Korekta sekwencji flankującej CGACGACGACG + analogicznie po prawej strony
-
Przy uruchomieniu programu plik wsadowy z listą genomów, nazwy plików genomowych dowolne
-
W kolumnie O ("FRG NO") - wpis generowany ręcznie, do automatyzacji. ciąg znaków z nagłowka pliku fasta (>..." ") prefix-indeks
-
Podobieństwo sekwencji w ramach iteriors.txt ("wnętrza")