En este trabajo se incluyeron las secuencias del gen 16S del ARNr de los 63 pacientes hospitalizados y diagnosticados con Trastorno Depresivo Mayor (MDD), y los 30 controles saludables (CS) del trabajo publicado de Dong et al. (2022). Los archivos SRA sin procesar se extrajeron de la NCBI Short Read Archive, bajo el ID BioProject PRJNA778934.

1. sratoolkit.Rmd

2. dada2.R

3. phyloseq.R

4. analisis_microbioma.R

5. MicrobiotaProcess.R

6. LEFSe.R

7. microeco

Este repositorio forma parte de la realización de una tesis de licenciatura por parte del Laboratorio de Biología Cuantitativa y Sistemas Complejos de la Licenciatura en Microbiología de la Universidad Autónoma de Querétaro.

Tesista: Gabriela Montserrat Torres Fernández 🧑‍🎓

Correo de contacto: [email protected]