Giter VIP home page Giter VIP logo

covid19-tutu's Introduction

covid19-tutu

TODO

  • Разбиение на транспорт
    • Добавить рёбра под виды транспорта
    • Посчитать константы для видов траспорта
    • Добавить модель на пересчёт числа заболевших в пути
  • Уточнение модели для города
    • Подобрать константы recovery rate, contact rate
    • Разбиение по возрастным группам (группа риска 65+)
  • Покрутить параметры, посмотреть что получится:
    • Симулировать карантин (снизить contact rate)
    • Удалёнка рёбер (выкинуть часть рейсов)
  • Посмотреть насколько влияет инициализация
    • Официальная статистика собирается через гузно: насемплировать разных случайных инициализаций
    • Данные по транспорту шумные: пошатать частоты перемещения в разных направлениях

Как оно работает сейчас

На каждую итерацию у нас есть два цикла: в первом мы обновляем считаем динамику в городах, в следующем перемещаем между городами людей.

В городе сейчас считается SIR модель. Можно учитывать намного больше разных деталей, вроде возрастных групп, сообществ, случайных факторов, но нужно помнить, что это потребует уточнения и по транспорту (например если добавим возрастные группы в городе, надо будет добавить их и по перемещениям), во-вторых может оказаться, что SIR даст тот же результат, если ей чуть параметры подвинуть.

Между городами перемещение реализовано самым наивным способом. Здесь легко добавить реалистичности не трогая модель города. Однако тоже может оказаться, что тот же результат получится линейным преобразованием от наивного способа, то есть подкруткой скорости транспорта, например.

Первым делом

Перебрать параметры и посмотреть что на что влияет, а что вовсе не важно. Точные числа мы скорее всего не предскажем, или не сможем проверить, а динамику и зависимости знать важно.

Описание data

raw_data.csv - как к нам данные пришли от туту.

cities.csv - заполненные данные по городам из датасета. Везде есть координаты и население.

cities_infection.csv - добавлены столбцы с заболевшими и выздоровевшими по датам: 16.03 - 23.03

full_graph.csv - данные с маршрутами с заполненными полями. Удобно для визуализации.

age65.csv - группа риска 65+ с разбиением по регионам.

cities_infection.csv - добавлены столбцы с заболевшими/выздоровевшими в файл cities с датами: 16.03 - 22.03

CSSEGISandData - исторические данные по заболеваемости от института Джона Хопкинса (https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19/tree/master/csse_covid_19_data/csse_covid_19_time_series). Данные обновляются ежедневно

population.csv - народонаселение по городам (https://datahub.io/JohnSnowLabs/population-figures-by-country)

cities_new.csv - добавлены данные по плотности населения (http://worldgeo.ru/russia/lists/?id=26), количеству аппаратов ИВЛ и ЭКМО (https://meduza.io/feature/2020/03/20/v-italii-iz-za-koronavirusa-katastroficheski-ne-hvataet-apparatov-ivl-v-rossii-ih-gorazdo-bolshe-no-eto-ne-znachit-chto-my-luchshe-gotovy-k-epidemii), а также по уровню развития инфраструктуры и общественной жизни (чистота, транспорт, спорт, магазины: https://www.domofond.ru/statya/polnyy_reyting_250_gorodov_rossii_po_kachestvu_zhizni/6764)

Recommend Projects

  • React photo React

    A declarative, efficient, and flexible JavaScript library for building user interfaces.

  • Vue.js photo Vue.js

    🖖 Vue.js is a progressive, incrementally-adoptable JavaScript framework for building UI on the web.

  • Typescript photo Typescript

    TypeScript is a superset of JavaScript that compiles to clean JavaScript output.

  • TensorFlow photo TensorFlow

    An Open Source Machine Learning Framework for Everyone

  • Django photo Django

    The Web framework for perfectionists with deadlines.

  • D3 photo D3

    Bring data to life with SVG, Canvas and HTML. 📊📈🎉

Recommend Topics

  • javascript

    JavaScript (JS) is a lightweight interpreted programming language with first-class functions.

  • web

    Some thing interesting about web. New door for the world.

  • server

    A server is a program made to process requests and deliver data to clients.

  • Machine learning

    Machine learning is a way of modeling and interpreting data that allows a piece of software to respond intelligently.

  • Game

    Some thing interesting about game, make everyone happy.

Recommend Org

  • Facebook photo Facebook

    We are working to build community through open source technology. NB: members must have two-factor auth.

  • Microsoft photo Microsoft

    Open source projects and samples from Microsoft.

  • Google photo Google

    Google ❤️ Open Source for everyone.

  • D3 photo D3

    Data-Driven Documents codes.