Tutorial creado por Manuel J. Parra Royón para el Departamento de Estadística e Investigación Operativa de la Universidad Pública de Navarra.
- Arquitectura del sistema de ejemplo
- Previo a la instalación
- Instalación de Hadoop y HDFS
- Instalación de Spark
- Comenzar con Spark+R
- 4 Nodos
- Nodo Master/Cabecera: 192.168.1.10 -> lola01
- Nodo Esclavo: 192.168.1.11 -> lola02
- Nodo Esclavo: 192.168.1.12 -> lola03
- Nodo Esclavo: 192.168.1.13 -> lola04
Se instalará el siguiente software:
- Hadoop 2.6.0
- JAVA 1.8 (o superior a 1.6)
- Scala 2.11.8
- Spark 2.0.1
- R (superior a 3.XX)
- Tener instalado JAVA. La versión concreta de JAVA debe estar instalada en todos los nodos en el mismo directorio. En caso contrario instalar siguiendo los pasos de Instalación Java.
- Deshabilitar SELinux.
- Firewall IPTABLES habilitado con los puertos abiertos adicionales para Hadoop/Spark en todos los nodos:
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 50090 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 50105 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 50075 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 50070 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 50475 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 50470 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 8032 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 8030 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 8088 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 8090 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 8031 -j ACCEPT
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 8033 -j ACCEPT
Para todos los nodos editamos el fichero /etc/hosts y añadimos lo siguiente:
[todos_nodos]$ vi /etc/hosts
y añadimos (en caso de que no estén):
192.168.1.10 lola01
192.168.1.11 lola02
192.168.1.12 lola03
192.168.1.13 lola04
Es importante indicar los nombres de los host correctamente.
Para todos los nodos hay que crear el usuario hadoop:
[todos_nodos]$ useradd hadoop
y luego:
[todos_nodos]$ passwd hadoop
Utiliza un password robusto para este usuario.
Realiza estos dos pasos en todos los nodos.
Usamos el usuario que acabamos de crear:
[root@lola01]$ su hadoop
Generamos las claves:
[hadoop@lola01]$ ssh-keygen -t rsa
Pulsa INTRO siempre que lo pregunte; deja todas las opciones por defecto y en la clave que pide, igualmente pulsa INTRO.
Ahora copiamos la clave publica al usuario hadoop en todos los nodos:
[hadoop@lola01]$ ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub hadoop@lola01
[hadoop@lola01]$ ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub hadoop@lola03
[hadoop@lola01]$ ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub hadoop@lola03
[hadoop@lola01]$ ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub hadoop@lola04
Nos pedirá la clave de usuario hadoop que hemos creado previamente para el usuario hadoop.
[hadoop@lola01]$ chmod 0600 ~/.ssh/authorized_keys
Realizar este proceso para cada uno de los nodos. De modo que todos pueda conectar a los otros sin tener que usar clave.
Haz este paso sólo si no tienes instalado JAVA o bien quieres actualizar la versión de JAVA:
Descargar el JDK: https://drive.google.com/file/d/0ByPBMv-S_GMENlNBQzRxNmtYeWc/view?usp=sharing
En este caso usamos la ultima version disponible del JDK de la página de ORACLE:
Vamos al nodo Master lola01, como root:
cd /opt
Descargamos ahí el paquete del JDK JAVA
Descargar el fichero: https://drive.google.com/file/d/0ByPBMv-S_GMENlNBQzRxNmtYeWc/view?usp=sharing y guardarlo en el nodo lola01 en la carpeta /opt
Descomprimir el fichero:
tar -zxf java8.tar.gz
En este caso se ha descargado la versión jdk1.8.0_131.
Realizamos una copia del JDK JAVA en cada nodo:
[root@lola01]$ scp -r jdk1.8.0_131 lola02:/opt
[root@lola01]$ scp -r jdk1.8.0_131 lola03:/opt
[root@lola01]$ scp -r jdk1.8.0_131 lola04:/opt
Ahora configuramos la versión de JAVA que vamos a usar. Hacemos lo siguiente en cada nodo:
[root@todos_nodos]$ alternatives --install /usr/bin/java java /opt/jdk1.8.0_131/bin/java 2
[root@todos_nodos]$ alternatives --config java
[root@todos_nodos]$ alternatives --install /usr/bin/jar jar /opt/jdk1.8.0_131/bin/jar 2
[root@todos_nodos]$ alternatives --install /usr/bin/javac javac /opt/jdk1.8.0_131/bin/javac 2
[root@todos_nodos]$ alternatives --set jar /opt/jdk1.8.0_131/bin/jar
[root@todos_nodos]$ alternatives --set javac /opt/jdk1.8.0_131/bin/javac
Ahora creamos las variables de entorno en todos los nodos:
[root@todos_nodos]$ vi /etc/bashrc
Añadimos al final:
[root@todos_nodos]$ export JAVA_HOME=/opt/jdk1.8.0_131
[root@todos_nodos]$ export JRE_HOME=/opt/jdk1.8.0_131/jre
[root@todos_nodos]$ export PATH=$PATH:/opt/jdk1.8.0_131/bin:/opt/jdk1.8.0_131/jre/bin
La ruta de JAVA debe ser la misma donde se ha instalado JAVA en el paso previo.
Fijamos los exports:
[root@todos_nodos]$ source /etc/bashrc
y validamos que tenemos el HOME de JAVA:
echo $JAVA_HOME
Accedemos al nodo de cabecera lola01:
[root@lola01]$ cd /opt
[root@lola01]$ curl -O http://www.eu.apache.org/dist/hadoop/common/hadoop-2.6.5/hadoop-2.6.5.tar.gz
[root@lola01]$ tar -zxf hadoop-2.6.5.tar.gz
[root@lola01]$ rm hadoop-2.6.5.tar.gz
[root@lola01]$ mv hadoop-2.6.5 hadoop
Copiamos a los demas nodos:
[root@lola01]$ scp -r hadoop lola02:/opt
[root@lola01]$ scp -r hadoop lola03:/opt
[root@lola01]$ scp -r hadoop lola04:/opt
Ahora realizamos las siguientes operaciones en todos los nodos, usando el usuario hadoop:
[root@todos_nodos]$ su hadoop
[hadoop@todos_nodos]$ vi /home/hadoop/.bashrc
Añadimos al final del fichero:
export HADOOP_PREFIX=/opt/hadoop
export HADOOP_HOME=$HADOOP_PREFIX
export HADOOP_COMMON_HOME=$HADOOP_PREFIX
export HADOOP_CONF_DIR=$HADOOP_PREFIX/etc/hadoop
export HADOOP_HDFS_HOME=$HADOOP_PREFIX
export HADOOP_MAPRED_HOME=$HADOOP_PREFIX
export HADOOP_YARN_HOME=$HADOOP_PREFIX
export PATH=$PATH:$HADOOP_PREFIX/sbin:$HADOOP_PREFIX/bin
Fijamos los export:
[hadoop@todos_nodos]$ source .bashrc
Ahora hacemos los siguientes cambios en todo los nodos:
[hadoop@todos_nodos]$ vi /opt/hadoop/etc/hadoop/core-site.xml
Añadir (ten en cuenta el nombre del servidor lola01):
<configuration>
<property>
<name>fs.defaultFS</name>
<value>hdfs://lola01:9000/</value>
</property>
</configuration>
Ahora realizar lo siguiente:
[root@todos_nodos]$ chown hadoop /opt/hadoop/ -R
[root@todos_nodos]$ chgrp hadoop /opt/hadoop/ -R
[root@todos_nodos]$ mkdir /home/hadoop/datanode
[root@todos_nodos]$ chown hadoop /home/hadoop/datanode/
[root@todos_nodos]$ chgrp hadoop /home/hadoop/datanode/
Luego configurar el fichero: /opt/hadoop/etc/hadoop/hdfs-site.xml en todos los nodos como usuario hadoop:
[hadoop@todos_nodos]$ vi /opt/hadoop/etc/hadoop/hdfs-site.xml
y añadimos:
<configuration>
<property>
<name>dfs.replication</name>
<value>3</value>
</property>
<property>
<name>dfs.permissions</name>
<value>false</value>
</property>
<property>
<name>dfs.datanode.data.dir</name>
<value>/home/hadoop/datanode</value>
</property>
</configuration>
Ahora sólo en el master lola01:
[hadoop@lola01]$ mkdir /home/hadoop/namenode
[hadoop@lola01]$ chown hadoop /home/hadoop/namenode/
[hadoop@lola01]$ chgrp hadoop /home/hadoop/namenode/
Editamos /opt/hadoop/etc/hadoop/hdfs-site.xml en lola01. Añadimos lo siguiente, aunque ya debería estar:
<property>
<name>dfs.namenode.data.dir</name>
<value>/home/hadoop/namenode</value>
</property>
Edita en lola01 /opt/hadoop/etc/hadoop/mapred-site.xml. No exitirá el fichero, así que
debes copiar un fichero de template a este fichero:
[hadoop@lola01]$ cp /opt/hadoop/etc/hadoop/mapred-site.xml.template /opt/hadoop/etc/hadoop/mapred-site.xml
[hadoop@lola01]$ vi /opt/hadoop/etc/hadoop/mapred-site.xml
<configuration>
<property>
<name>mapreduce.framework.name</name>
<value>yarn</value>
</property>
</configuration>
Edita en lola01 /opt/hadoop/etc/hadoop/yarn-site.xml para preparar el ResourceManager y NodeManagers:
<property>
<name>yarn.resourcemanager.hostname</name>
<value>hmaster</value>
</property>
<property>
<name>yarn.nodemanager.hostname</name>
<value>hmaster</value> <!-- or hslave1, hslave2, hslave3 -->
</property>
<property>
<name>yarn.nodemanager.aux-services</name>
<value>mapreduce_shuffle</value>
</property>
Luego únicamente en lola01 :
[hadoop@lola01]$ vi /opt/hadoop/etc/hadoop/slaves
Añadir los nodos
lola01
lola02
lola03
lola04
Finalmente añadir las siguiente líneas a /etc/sysctl.conf en todos los nodos:
net.ipv6.conf.all.disable_ipv6 = 1
net.ipv6.conf.default.disable_ipv6 = 1
Entramos en el MASTER lola01 y hacemos lo siguiente para primero formatear hdfs y ejecutar el servicio HDFS:
[root@lola01]$ su hadoop
[hadoop@lola01]$ hdfs namenode -format
Arrancamos HDFS, siempre desde el nodo Cabecera:
[hadoop@lola01]$ cd /opt/hadoop/sbin/
[hadoop@lola01]$ ./start-dfs.sh
Comprobamos que todo es correcto:
[hadoop@lola01]$ jps
o bien intentado acceder a la URL: http://lola01:50070/
Por ultimo arrancamos YARN:
[hadoop@lola01]$ cd /opt/hadoop/sbin/
[hadoop@lola01]$ ./start-yarn.sh
Comprobamos HDFS como el usario hadoop. Para ello creamos la carpeta /user que permitirá que cada usuario del sistema pueda utilizar HDFS desde su cuenta de usuario. De modo que si creamo otro usuario p.e. manuparra, y luego creamos la carpeta en HDFS, podrá acceder a su directorio en HDFS de forma directa.
hdfs dfsadmin -safemode leave
hdfs dfs -mkdir /user
hdfs dfs -mkdir /user/hadoop/
Creamos un fichero de prueba y probamos copiarlo:
[hadoop@lola01]$ vi test.file
añadimos contenido al fichero y luego lo movemos a la carpeta en HDFS del usuario:
[hadoop@lola01]$ hdfs dfs -copyFromLocal test.file /user/hadoop/
Validamos que está el fichero copiado al espacio HDFS:
[hadoop@lola01]$ hdfs dfs -ls /user/hadoop/
Para todos los nodos usando el usuario root
- Descargamos Spark 2.0.1
[root@todos_nodos]$ curl -O http://apache.rediris.es/spark/spark-2.0.1/spark-2.0.1-bin-hadoop2.7.tgz
- Descomprimimos el fichero de Spark:
[root@todos_nodos]$ tar xfvz spark-2.0.1-bin-hadoop2.7.tgz
Copiamos Spark a su caperta:
[root@todos_nodos]$ mv spark-2.0.1-bin-hadoop2.7 /usr/local/spark
Descargamos Scala
[root@todos_nodos]$ curl -O http://downloads.lightbend.com/scala/2.11.8/scala-2.11.8.tgz
Descomprimimos Scala y lo movemos a su caperta
[root@todos_nodos]$ tar xfvz scala-2.11.8.tgz
[root@todos_nodos]$ mv scala-2.11.8 /usr/local/scala
Establecemos los PATH para scala y spark:
echo 'export PATH=$PATH:/usr/local/spark/bin/' >> $HOME/.bash_profile
echo 'export PATH=$PATH:/usr/local/scala/bin/' >> $HOME/.bash_profile
echo 'export SPARK_HOME=/usr/local/spark/' >> $HOME/.bash_profile
Ejecutamos para setear los exports:
[root@todos_nodos]$ source .bash_profile
[root@todos_nodos]$ cp $SPARK_HOME/conf/spark-env.sh.template $SPARK_HOME/conf/spark-env.sh
Añadimos al final del fichero $SPARK_HOME/conf/spark-env.sh estás variables :
[root@todos_nodos]$ vi $SPARK_HOME/conf/spark-env.sh
Hay que modificar en estos tres parámetros lo siguiente:
- El PATH al JAVA_HOME
- La IP del nodo concreto; es decir la ip local del nodo por ejemplo si estoy en lola02, pondría : 192.168.1.11
- El número de cores máximos del nodo local
export JAVA_HOME=/opt/jdk1.8.0_131
export SPARK_PUBLIC_DNS="<IP LOCAL>"
export SPARK_WORKER_CORES=<CORES>
Ahora sólo para el nodo Cabecera lola01
[root@lola01]$ vi $SPARK_HOME/conf/slaves
Añadimos los nodos esclavos de Spark:
lola02
lola03
lola04
lola05
Por último, como root desde lola01, copiar claves píblicas a los otros nodos:
ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub root@lola01
ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub root@lola02
ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub root@lola03
ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub root@lola04
ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub root@lola05
Finalmente para arrancar el cluster de Spark, ejecutar desde el nodo de cabecera lola01:
$SPARK_HOME/sbin/start-all.sh
Chequear que todo es correcto accediendo a:
Necesitamos tener instalado R. En caso de no tener instalado R, usamos:
yum install epel-release
yum install R
Ahora probamos que podemos aprovechar Spark+R. Entramos en R
R
y dentro del entorno de R usamos lo siguiente:
library(SparkR, lib.loc = c(file.path(Sys.getenv("SPARK_HOME"), "R", "lib")))
sparkR.session(master = "local[*]", sparkConfig = list(spark.driver.memory = "2g"))
Ya está disponible Spark+R para poder utilizarlo.
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