• エラーなどうまく動かない場合は、一番下のFAQをお読みください。

• ICレコーダの録音データから変換されたスペクトログラムをRStudio上で表示します。
• 見覚えのある声紋があればクリックし、メニューから種名を選択することで、日時と種名がcsvファイルに出力されます。
• 迷う場合はメニューから"再生"を選べば、音が再生できます（SoXのインストールが必要）。
• 再生の後にわかれば種名を選び、わからなければ不明種(WAY?: Who Are You?)としてクリック前後の数秒の音を保存できます。 -The spectrogram converted from the recording data of the IC recorder is displayed on RStudio. -Click on a familiar voiceprint and select the species name from the menu. The date and species name will be output to the csv file. -If you are unsure, select "Play" from the menu to play the sound (SoX must be installed). -Select a species name if you know it after playback, and save a few seconds before and after clicking as an unknown species (WAY ?: Who Are You?).

1. MacOSX
2. Windows10
3. 多分Linux系もOKでしょう

1. R
2. RStudio
3. SoX

編集中

ファイル名を下記の666形式の録音日時に変更してください。

例えば、2019年05月01日23:00:00から翌日の05月02日02:00:00までの音源データなら "開始日にち_開始時刻-終了時刻_xxx.拡張子”という風に変更してください。”_”と”-“を区別してください。xxxの部分はあってもなくても構いません。

original filename: DS700143.WMA modified filename: 190501_230000-020000_DS700143.WMA

これを6_6-6形式とあるいは単純に666形式と呼んでいます。

$tree -d
.
└── toriR_demo
    ├── 190501
    └── ORG

• ICレコーダの音源はORGというフォルダに入れてください。その親のフォルダに日にち毎のディレクトリが作られて、そこに音声ファイル(.wav)と、スペクトログラム(.png)、設定ファイル(.psgrm)ができます。()は拡張子です。

toriR is based on processing for one hour. For example, if the recording is 1 hour from 23:00:00 on May 01, 2019, the following input files are required: （toriRは1時間分の処理を基本としており、例えば録音が2019年05月01日23:00:00から1時間の場合、次の入力ファイルが必要です）

Input files:
190501_230000-000000.wav(sound:音声ファイル)
190501_230000-000000.psgrm(parameter:パラメータファイル)
190501_230000-000000_P05.png(spectrogrum for four minutes:4分のスペクトログラム)

~
190501_230000-000000_P15.png

Output file is csv file The output file of toriR is a csv file, and the output information is "date, time, species name and clickpoint frequency" obtained by clicking the spectrogram and selecting the bird list. (toriRの出力ファイルはcsvファイルで、クリックとリスト選択された結果が出力されます。それらの情報は、"日にち、時刻、種名とクリックした周波数"で、1行毎に出力されます。))

Output file: 190501_230000-000000.csv

# value is default.
fftsize=1024;#Fast Fourie Transfer size (512 or 1024)｜FFTサイズ
f_lcf=0000;           #Frequency of low cut filter[Hz]｜周波数の加減
f_hcf=12000;          #Frequency of high cut filter[Hz]｜周波数の上限
height_image="125";   #Image height of Spectrogram
ratio_clip="20";      #Clipping ratio of sound spectrogram generated
thrsd_clip_lo="-200"; #Threshold of clipping value of low side of spectrogram gererated
thrsd_clip_hi="-100"; #Threshold of clipping value of high side of spectrogram gererated
window_time="60";     #Spectrogram time window｜スペクトログラムの時間幅
width_image="624";    #Image width of Spectrogram
windows_a_page="4";   #Spectrograms a page｜1頁のあたりのスペクトログラム

1. Open RStudio; # RStudioを開く
2. Load 'toriR.Rcode; #toriR`コードを読み込む

1. Set date parameter date_analysis: date_analysis <- 190501;(date_analysisを6桁の日にちを指定)
2. Set time parameter time_analysis_sart as a charactor: (time_analysisを文字列として開始時刻を指定する)
3. Edit candidates of bird's name of spices as a vector: (spicesに鳥の声の種名を登録する。種名を""の中に入れる)

spices <- c(
"play", "WAY｜save", "noise", "owl", "White's Thrush", "Japanese Green Pigeon"
);

4. Edit playing setting(option)(再生の設定(オプション))

`volume` <- 8;# play volume;(再生音量の`volume`を設定)
`length_preplay` <- 1.; # length of playing time befor click(クリックより前の再生時間)
`length_play` <- 3;     # length of playing time after click(クリックの後の再生時間)

1. Run of all toriR source code (toriRの全てのソースコードを実行する)
2. Click bird's voice on the spectrogram image (toriRのスペクトログラム画像上の鳥の声紋をクリック)
3. Select bird's name or play from list after moving focus on console) (コンソール上にフォーカスし、リストから鳥の名前を選ぶ)
4. When move to the next page, click the white area outside of the spectrogrum range on Plots or press ESC key (次のページに移動するにはPlots上のスペクトログラムの範囲外の白い部分をクリックするかESCキーを押す)
5. When skip the rest of pages, press ESC immediately after clicking on the plot (残りのページをスキップしたい場合は、プロット上をクリックした直後にEscキーを押します)

190501_230000-000000.csv

1. [Q:Win]フォルダ名入力しCtrl+A→Ctrl+Enterを行ったところ文字化けしてエラーになってしまいました。
   • RStudioでtoriRを読み込ませて文字化けする場合はReopen with encordingでUTF-8を選んで呼んでください。