https://colab.research.google.com/drive/1rkh9LTjdhWXzfEFQ9a0T_ZY32Cw93OEA?usp=sharing
| Образец | Кол. последовательностей | Длина генома | Кол. генов | Доля генов | Кол. Z-dna>500 | Общая длина Z-dna>500 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Cellulomonas fimi ATCC 484 | 1 | 4266344 | 3871 | 0.90158553 | 36858 | 484888 |
| Cellulomonas flavigena DSM 20109 | 1 | 4123179 | 3760 | 0.90175663 | 35484 | 467186 |
| Cellulomonas gilvus ATCC 13127 | 1 | 3526441 | 3248 | 0.91277438 | 33080 | 446507 |
| Cellulomonas iranensis | 1 | 4046676 | 3638 | 0.89839636 | 43205 | 588917 |
| Cellulomonas shaoxiangyii | 1 | 3909366 | 3504 | 0.9004941 | 35658 | 479625 |
Всего выявлено 3637 кластеров.
Были выбраны следующие из них:
| Кластер | Кол. генов | Функция | ср. знач. Z-DNA score |
|---|---|---|---|
| 1990 | 7 | thioredoxin-disulfide reductase activity | 10331 |
| 1461 | 8 | ATP-binding | 8005 |
| 1843 | 7 | gluconokinase, Carbohydrate transport and metabolism | 8831 |
| 127 | 7 | ABC transporter ATP-binding protein | 10295 |
| 2143 | 7 | ABC transporter ATP-binding protein | 20922 |
Выравнивание производилось с помощью MUSCLE 3.8:
Кластер 1990:
Кластер 1461:
Кластер 1843:
Кластер 127:
Кластер 2143:
Визуализация расположения Z-DNA относительно генов:
Кластер 1990:
Кластер 1461:
Кластер 1843:
Кластер 127:
Кластер 2143:
React
Typescript
Django
Laravel
Facebook
Microsoft
Google
Alibaba
D3
Tencent