В ОС Windows (версии 8 и 10) все тесты фэйлятся на этапе чтения из файла:
java.nio.file.InvalidPathException: Illegal char <:> at index 2: /C:/Projects/smevx-crypto/build/resources/test/smev2-test-msg.xml

Если в методе SignVerifyTest.loadResource() заменить

final byte[] encoded = Files.readAllBytes(Paths.get(url.getPath()));

на

final byte[] encoded = Files.readAllBytes(Paths.get(url.toURI()));

эта ошибка исчезает.

Пытаюсь получить PKS#7 подпись.

import ru.smevx.crypto.smev3.cms.*;
...

File file = new File("my_file.zip");
byte[] data = getBytesFromFile(file);
byte[] pks7Data = PKCS7Utils.sign(privateKey, cert, data);

boolean isValid = PKCS7Utils.validate(pks7Data, data);

программа возвращает True. Однако при отправе в смэв 3 - смэв 3 ругается что подпись не валидная: MEV-100:Проверка подписи на вложении req_21a74dd1-f48e-4779-9d76-62a2b2b7e484.zip: Подпись не прошла проверку по сертификату.

сертификат с алгоритмом гост 2012.

Владимир, не могли вы прислать или выложить пример с исходным XML, чтобы можно было прогнать через https://smev3.gosuslugi.ru/portal/checkxmlform.jsp, версия схемы 1.2.
Складывется впечатление, что КриптоПРО JCP, не может работать со СМЭВ 3.
Написал в форум, может там что подскажут https://www.cryptopro.ru/forum2/default.aspx?g=posts&m=88989#post88989.

За ранее, благодарен.

Предлагаю добавить примеры рекомендуемого использования и/или проверки в виде модульных тестов.

Такие примеры помогут пользователям библиотеки быстрее начать работать с ней и снизят количество ошибок из-за неправильного использования.